Банкротство компании начато в апреле 2017 года по заявлению ФНС РФ [1], сообщает РАПСИ. Заявление налоговый орган подал в связи с неуплатой обязательных платежей по страховым взносам на обязательное медицинское и пенсионное страхование за 2014-2015 годы. «Когалымавиа» настаивала, что компания готова погасить долги, однако ей необходимо время.
Летный сертификат «Когалымавиа» был ограничен в марте 2016 года после авиакатастрофы над Синаем [2] и последовавших за этим проверок, которые выявили многочисленные нарушения воздушного законодательства, а также в области финансово-экономического состояния перевозчика [3], что влияет на безопасность полетов.