Согласно распоряжению правительства, опубликованному на официальном сайте кабмина, планируется реализовать 32,39% уставного капитала предприятия. На данный момент оно находится на балансе Федерального агентства по управлению государственным имуществом.
По данным Росстата от 26 июня 2014 года, другим мажоритарным акционером компании является ООО «Фармацевтическое бюро» (принадлежит рекламной группе «Пасспорт РГ») – оно владеет 33,46% доли уставного капитала. Среди крупных миноритариев «Синтеза» – небанковская кредитная организация ЗАО «Национальный расчетный депозитарий» (13,71%) и ЗАО «СИА Интернейшнл ЛТД» (13,05%).
